Contrat à durée déterminée - 12 Mois : (Contrat travail)
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Mission :
Les interactions humaines et le commerce international ont accéléré la propagation d'espèces et de virus envahissants, qui ont de graves conséquences économiques, environnementales et écologiques. La pandémie de COVID-19, qui a circulé dans 206 pays et a entraîné des millions de décès, est un exemple frappant de notre fragilité face aux agents pathogènes et de la rapidité et de l'ampleur de leur propagation en raison du commerce et des voyages. Cette crise sanitaire en cours met également en évidence les principales limites des méthodes actuelles de dépistage médical, qui se limitent à quelques centaines de tests/1Mpop/jour et restent extrêmement lentes en situation d'épidémie. En outre, elle montre que la transmission virale, en particulier par voie aérienne, n'est pas bien comprise, en raison du manque de techniques capables de détecter les virus en suspension dans l'air. Avec l'augmentation de la mobilité humaine, les pandémies virales et/ou bactériennes devraient menacer de plus en plus notre survie. Pour les contenir, nous devons accélérer les tests médicaux et accroître leur accessibilité à une population plus large. En résumé, il est clairement nécessaire de développer les capacités de détection des agents pathogènes et des virus aux premiers stades de l'infection, afin de gérer efficacement leurs impacts sur la santé.
Une approche prometteuse, testée pendant la pandémie de COVID-19, consiste à analyser l'air expiré, qui contient des composés organiques volatils (COV). La détection de COV spécifiques liés à des maladies ou à des processus métaboliques spécifiques pourrait améliorer considérablement le diagnostic des maladies, offrant une alternative rapide, non invasive et rentable aux méthodes de diagnostic conventionnelles.
L'objectif de ce projet est de développer une méthodologie basée sur des techniques de spectrométrie de masse (e.g., Vocus-PTR) pour analyser les COV dans l'air expiré afin d'identifier les métabolites permettant l'identification des infections virales et bactériennes, notamment les virus de la grippe, le SARS-CoV-2 et Legionella pneumophila.
Activités :
Les composés présents dans l'air expiré reflètent directement le métabolisme humain et peuvent donc indiquer l'état physiopathologique de l'organisme et servir en outre de marqueurs potentiels à de nombreuses pathologies comme les cancers ou les infections virales.
Vous travaillerez à la conception d'une nouvelle méthodologie pour détecter des composés présents dans l'air expiré qui pourront révéler des infections virales (SARS-CoV-2, grippe) et bactérienne (Legionella pneumophila).
Aussi simple et rapide qu'un éthylotest, cette méthodologie se base sur les incroyables performances d'une nouvelle génération d'instruments. Ainsi, un nouveau champ pour le dépistage de pathologies respiratoires pourrait voir le jour.
Pour ce faire, vous vous concentrerez sur :
1- le développement du système expérimental pour étudier l'émission de COV des cultures cellulaires qui seront infectées par des bactéries et des virus.
2- l'analyse des COV par Vocus-PTR pendant l'essai clinique. Plus spécifiquement, vous serez en charge de l'instrument Vocus-PTR.
Vous serez responsable de l'analyse des données COV collectées au cours des différentes tâches et d'interagir directement avec les biostatisticiens pour développer une méthodologie d'analyse permettant d'identifier les biomarqueurs et le profil COV.
Votre activité se déroulera principalement en laboratoire. Vous serez en charge de :
La conception, l'automatisation ainsi que la caractérisation de l'enceinte qui servira à caractériser les émissions de COV.
Le couplage avec le spectromètre de masse à transfert de proton et assurerez également la maintenance.
